第一次发生生殖器疱疹后，经过一定的治疗或未经治疗，患者会逐渐好转，疱疹消退。但此时并不能说明生殖器疱疹已经痊愈，几乎100%的患者会出现复发性生殖器疱疹。这是由于生殖器疱疹病毒潜伏于局部粘膜引起的
，复发性生殖器疱疹多在原发疹后1～4月内复发。复发后一般均在原处，全身症状轻，病程较短，皮损约10天左右消退。 原发或复发生殖器疱疹可伴有排尿困难、急性尿潴留、脑炎、子宫内膜炎、疱疹性瘭疽等严重的疾患。
